《奈米使徒计划》是一款科幻风格的 Boss Rush 动作游戏。主打刺激的头目战与「破坏点」的战斗机制。玩家扮演一位被植入奈米机械的少女,与她的奈米机械共同对抗残暴的生化兵器,并寻求逃出研究所的一线生机。故事发生在一所生化兵器的秘密研究所,玩家扮演因实验而生的少女——「安妮塔」以及被植入进她体内的奈米机械——「使徒」,在不断被安排与其他生化兵器匹配战斗的同时,寻求逃出这个炼狱般的研究所的机会。与各种强大残酷的生化兵器厮杀手持巨斧的战斗机甲、散播焦油与火焰的潜地巨兽、甚至是操弄精神恐惧的死神,与各种凶残且富含挑战的生化兵器进行血光四溅的交战,以及在战胜后实行无情彻底的处决。複数的战斗阶段所有敌人都拥有多段的战斗变体,每当击败敌人后,它们都会带着更激进的战斗模式再度来袭,玩家需要在战斗中调整应对策略,在更激烈的战斗下对抗敌人拼死一搏的攻势。富含操作性的战斗系统在攻击与格挡的切换间与敌人进行互有来回的战斗,透过射击敌人来对其植入奈米机械,从而破坏其内部,使出蓄力攻击重创敌人、利用迴旋斩一边伤害敌人一边巧妙地迴避攻击。以及在敌人踉跄时利用鈎索快速接近并对其造成重大的伤害。以各种战斗操作来与敌人